IDT xGen® Exome Research Panel

El xGen Exome Research Panel v1.0 consta de 429,826 sondas XGen Lockdown® sintetizadas individualmente y de calidad controlada. El Exome Research Panel abarca una región objetivo de 39 Mb (19,396 genes) del genoma humano y cubre 51 Mb de espacio de sonda de extremo a extremo. Todas las sondas en el panel se fabrican usando estándares GMP. La espectrometría de masas y las mediciones de DO se toman para cada sonda para garantizar una representación adecuada de las sondas correctamente fabricadas en la piscina.

INFO GENERAL

La secuenciación del exoma es invaluable para secuenciar solo las regiones codificantes del genoma humano. Con exones que representan solo el 3% del genoma, es fundamental contar con un método eficaz para separar estas regiones del ADN no codificante y centrarse en las mutaciones potencialmente importantes implicadas en una enfermedad. El material capturado también debe ser adecuado para la secuenciación a una profundidad de cobertura satisfactoria para la detección confiable de alelos variantes.

 

  • Obtén resultados consistentes con sondas de captura sintetizadas individualmente fabricadas según los estándares GMP.
  • Alcanza una cobertura profunda y uniforme incluso en regiones difíciles ricas en GC.
  • Se integra con plataformas de secuenciación más populares.

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Paneles

La secuenciación del exoma es invaluable para secuenciar solo las regiones codificantes del genoma humano. Con exones que representan solo el 3% del genoma, es fundamental contar con un método eficaz para separar estas regiones del ADN no codificante y centrarse en las mutaciones potencialmente importantes implicadas en la enfermedad. El material capturado también debe ser adecuado para la secuenciación a una profundidad de cobertura satisfactoria para la detección confiable de alelos variantes.

El Panel de investigación xGen Exome consta de sondas oligonucleotídicas modificadas con biotina 5 ‘que se sintetizan individualmente y se analizan individualmente por espectrometría de masas por ionización por electrospray (ESI-MS) y medición de DO. Las sondas se normalizan antes de la agrupación para garantizar que cada sonda se represente en el panel en la concentración correcta. Las sondas que fallan en el control de calidad se resintetizan. Este riguroso proceso de fabricación otorga al Panel de investigación xGen Exome una ventaja única sobre los conjuntos derivados de arreglos, en los que las sondas faltantes o truncadas no pueden identificarse antes de la secuenciación. Al usar métodos de síntesis patentados por IDT, incluso las sondas con alto contenido de GC y AT se representan adecuadamente en el panel.

 

Para proporcionar una mayor profundidad de cobertura y permitir una alta multiplexación de muestras, el Panel de investigación xGen Exome se dirige solo a las secuencias codificantes (CDS) de los genes codificadores humanos en la base de datos RefSeq.

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