Secuenciación de ADN

Analitek trae a México la marca Illumina, reconocida mundialmente como la numero 1 en tecnología de secuenciación de siguiente generación (NGS), esta tecnología utiliza amplificación clonal y química de síntesis por secuenciación (SBS) para permitir una secuenciación rápida y precisa. El proceso identifica simultáneamente bases de ADN mientras las incorpora a una cadena de ácido nucleico. Cada base emite una señal fluorescente única a medida que se agrega a la cadena de crecimiento, que se usa para determinar el orden de la secuencia de ADN.

PARA QUE SECUENCIAR EL ADN

La tecnología NGS puede usarse para secuenciar el ADN de cualquier organismo, proporcionando información muy valiosa en respuesta a casi cualquier interrogante. Una tecnología altamente escalable, la secuenciación del ADN se puede aplicar a regiones pequeñas y específicas o al genoma completo a través de una variedad de métodos, lo que permite a los investigadores investigar y comprender mejor la salud o una enfermedad.

BENEFICIOS DE SECUENCIAR EL ADN

  • Permite secuenciar grandes porciones de ADN de forma masivamente paralela, esto nos da una posibilidad de mejorar la productividad y la escala de nuestro laboratorio cuando lo comparamos con la secuenciación de Sanger basada en la electroforesis capilar.
  • Proporciona alta resolución para tener una vista base por base de un gen, exoma o genoma.
  • Ofrece mediciones cuantitativas basadas en la intensidad de la señal.
  • Detecta prácticamente todos los tipos de alteraciones del ADN genómico, incluidas las variantes de nucleótidos sencillos, inserciones y eliminaciones, cambios en el número de copias y aberraciones cromosómicas.
  • Ofrece alta productividad y flexibilidad para escalar estudios y secuenciar múltiples muestras simultáneamente.

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Métodos comunes para secuenciar ADN

La secuenciación del genoma completo (WGS) es un método para analizar genomas completos. La información genómica ha sido fundamental para identificar trastornos hereditarios, caracterizar las mutaciones que conducen la progresión del cáncer y rastrear los brotes de enfermedades. La reducción rápida de los costos de secuenciación y la capacidad de producir grandes volúmenes de datos con los secuenciadores actuales hacen que la secuenciación del genoma completo sea una poderosa herramienta para la investigación genómica.

Este método es comúnmente asociado con la secuenciación de genomas humanos, la flexibilidad de la tecnología de secuenciación de próxima generación (NGS) lo hace igualmente útil para secuenciar cualquier especie, como ganado, plantas o microbios relacionados con enfermedades.

 

Metodos para secuenciar el genoma completo:

  • Secuenciación de genomas completos grandes: mayor a 5mb, de humanos, plantas, o animales, nos da valiosa información sobre enfermedades o genética poblacional.
  • Secuenciación de genomas completos chicos: menores a 5mb, como el genoma completo de una bacteria, virus, u otro microbio, esto sin requerir un cultivo bacterial, investigadores pueden secuenciar miles de organismos en paralelo usando la secuenciación de siguiente generación.
  • Secuenciación De Novo: esto involucra secuenciar un genoma nuevo del cual aun no hay información, la tecnologia NGS te da resultados rápidos y precisos para caracterizar cualquier especie.
  • Secuenciación Phased:Phased sequencing, or genome phasing, distinguishes between alleles on homologous chromosomes, resulting in whole-genome haplotypes. This information is often important for genetic disease studies.

Al combinar ensayos de inmunoprecipitación de cromatina (ChIP) con secuenciación, la secuenciación de ChIP (ChIP-Seq) es un método poderoso para identificar sitios de unión de ADN genómicos para factores de transcripción y otras proteínas. Siguiendo los protocolos de ChIP, la proteína unida al ADN se inmunoprecipita usando un anticuerpo específico. El ADN unido se coprecipita, purifica y secuencia.

La aplicación de la secuenciación de siguiente generación (NGS) a ChIP nos ha permitido descubrir sobre los eventos de regulación de genes que desempeñan un papel en diversas enfermedades y vías biológicas, como el desarrollo y la progresión del cáncer. ChIP-Seq permite hacer un examen exhaustivo de las interacciones entre las proteínas y los ácidos nucleicos en una escala de genoma completo.

Con la resecuenciación targeted, un subconjunto de genes o regiones del genoma se aíslan y secuencian. Los enfoques dirigidos que utilizan la secuenciación de próxima generación (NGS) permiten a los investigadores enfocar el tiempo, los gastos y el análisis de datos en áreas específicas de interés. Tal análisis dirigido puede incluir el exoma (la parte que codifica la proteína del genoma), genes específicos de interés (contenido personalizado), dianas dentro de los genes o ADN mitocondrial.

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